Table 1 List of primer sequences used in the study
Name | Sequence | Application |
|---|---|---|
PGRP5-F | 5′-CCTCAGCTCGCTCACATCCA-3′ | cDNA amplification |
PGRP5-R | 5′-AGAGTATAAATGTTCCCCCGGA-3′ | |
PGRP6-F | 5′-GTGTACACTCTCTCTGGTTTGC-3′ | |
PGRP6-R | 5′-CTGGTAACGCTCCCATGTCTGG-3′ | |
β-actin-F | 5′-TGGCATCACACCTTCTACAAC-3′ | |
β-actin-R | 5′-GCCCATCTCCTTGCTCGAAGTC-3′ | |
5′RACE Outer primer | 5′-CATGGCTACATGCTGACAGCCTA-3′ | RACE gene specific primers |
5′RACE Inner primer | 5′-CGCGGATCCACAGCCTACTGATGATCAGTCGATG-3′ | |
3′RACE Outer primer | 5′-TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT-3′ | |
3′RACE Inner primer | 5′-CGCGGATCCTCCACTAGTGATTTCACTATAGG-3′ | |
5′ PGRP5 Outer primer | 5′-TGGATGTGAGCGAGCTGAGGGACG-3′ | |
5′ PGRP5 Inner primer | 5′-ATCACAGTCTGTGCGGGACTCTTC-3′ | |
3′ PGRP5 Outer primer | 5′-CGTCCCTCAGCTCGCTCACATCCA-3′ | |
3′ PGRP5 Inner primer | 5′-GGAGATGGGATGGTGTATGAAGGG-3′ | |
5′ PGRP6 Outer primer | 5′-GTAACTCTTCAGCAGGTCACTCAG-3′ | |
5′ PGRP6 Inner primer | 5′-AACTTCTGACCCGAGAATGAACCC-3′ | |
3′ PGRP6 Outer primer | 5′-CAAGAGTGCGATGGACATGGTGAG-3′ | |
3′ PGRP6 Inner primer | 5′-GTCTTCATCATACTCCTTATACGG-3′ | |
PGRP5-qF | 5′-CCTCAGCTCGCTCACATCCA-3′ | Primers for Real-time PCR |
PGRP5-qR | 5′-CGCCCTTCATACACCATCCC-3′ | |
PGRP6-qF | 5′-ATGGTGAGGTATGACTTC-3′ | |
PGRP6-qR | 5′-CTTGTCTGTGTCCGTATA-3′ | |
S11-F | 5′-CCGTGGGTGACATCGTTACA-3′ | |
S11-R | 5′-TCAGGACATTGAACCTCACTGTCT-3′ |