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Table 2 Glycosylation pattern of PRRSV strains in Vietnam during 2007–2015

From: Molecular evolution of type 2 porcine reproductive and respiratory syndrome viruses circulating in Vietnam from 2007 to 2015

Year/Ref Strain

N-glycosylation site

Number of sequence

% of total

30

32

33

34

35

44

51

VR-2332

x

 

x

  

xxx

x

  

JXA1

x

   

x

xxx

x

  

2007

x

   

x

xx

x

1

0.69 %

x

    

xx

x

1

0.69 %

2008

x

   

x

xx

x

6

4.17 %

2009

x

   

x

xx

x

7

4.86 %

2010

x

   

x

xx

x

31

21.53 %

x

  

x

x

xx

x

1

0.69 %

x

   

x

 

x

1

0.69 %

   

x

 

xx

x

4

2.78 %

x

 

x

  

xx

x

3

2.08 %

2011

x

 

x

  

xx

x

1

0.69 %

x

   

x

xx

x

2

1.39 %

2012

x

   

x

xx

x

11

7.64 %

x

 

x

  

xx

x

2

1.39 %

 

x

x

  

xx

x

3

2.08 %

x

   

x

 

x

1

0.69 %

2013

x

  

x

x

xx

x

14

9.72 %

x

 

x

x

 

xx

x

2

1.39 %

x

 

x

  

xx

x

1

0.69 %

x

    

xx

x

2

1.39 %

x

   

x

xx

x

6

4.17 %

  

x

  

xx

x

1

0.69 %

    

x

xx

x

3

2.08 %

2014

x

   

x

 

x

1

0.69 %

x

 

x

   

x

1

0.69 %

x

  

x

x

xx

x

6

4.17 %

x

   

x

xx

x

15

10.42 %

x

 

x

  

xx

x

5

3.47 %

 

x

x

  

xx

x

1

0.69 %

  

x

  

xx

x

2

1.39 %

   

x

 

xx

x

1

0.69 %

2015

x

   

x

xx

x

9

6.25 %

  1. x: indicating the potential N-glycosylation site at cut off value; xx and xxx: indicating the potential N-glycosylation site at additional value (>0.75 and >0.9, respectively)