Skip to main content

Advertisement

Table 1 Results (threshold cycle values) of real-time PCR obtained from suspected clinical samples

From: A sheeppox outbreak in Morocco: isolation and identification of virus responsible for the new clinical form of disease

Identification number Nasal swab Ocular swab Rectal swab Blood Crusted scab Lung nodule
  TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay TaqMan assay
  (Ct value) (Ct value) (Ct value) (Ct value) (Ct value) (Ct value)
1 (outbreak n° 1) 25,93 25,97 30,83 36,2 19,88 -
2 (outbreak n° 1) 27,57 27,8 32,77 38 22,88 -
3 (outbreak n° 1) 29,12 31,08 28,32 37,6 - -
4 (outbreak n° 1) 30,28 30,83 40,03 30,75 - -
5 (outbreak n° 1) 31,97 32,8 35 39,87 19,59 -
6 (outbreak n° 1) 38,33 26,07 38,93 37,78 - -
7 (outbreak n° 1) 25,82 39,75 33,6 33,42 - -
8 (outbreak n° 1) No Ct 42,5 No Ct - - 18,7
9 (outbreak n° 1) 39,93 No Ct 39,21 37,1 - -
10 (outbreak n° 1) 38,3 22,97 30,32 37,8 - -
11 (outbreak n° 1) 24,03 24,5 37,17 40,93 20,98 -
12 (outbreak n° 1) 21,56 35,95 No Ct - - 17,95
13 (outbreak n° 2) 35,07 33,25 38,78 41,1 - -
14 (outbreak n° 2) 29,8 28,83 No Ct 36,5 - -
15 (outbreak n° 2) 30,69 34,64 42,5 30,29 - -
16 (outbreak n° 3) 36,64 31,21 35,6 No Ct - -
17 (outbreak n° 3) 34 29,86 36,04 No Ct - -
18 (outbreak n° 3) 29,7 33,5 38,75 - - 19,93
19 (outbreak n° 3) 34,2 33,93 34,93 40,75 - -
20 (outbreak n° 3) 33,92 36,33 38,2 36,4 -  
21 (outbreak n° 4) 35,07 37,9 39,5 33,96 -  
22 (outbreak n° 4) 40,48 40,16 41,1 - - 20,37
23 (outbreak n° 4) 41,7 35,87 35,1 No Ct - -
24 (outbreak n° 4) 40,16 35,83 34,83 38,04 - -
25 (outbreak n° 4) 35,66 33,3 39,5 35,86 - -
26 (outbreak n° 5) No Ct 33,95 35,32 No Ct - -
27 (outbreak n° 5) 37,5 31,39 40,3 40,68 - -
28 (outbreak n° 5) 33,96 30,42 39,5 - - 22,94
29 (outbreak n° 6) 27,5 27,5 38 No Ct - -
30 (outbreak n° 6) 40 27,18 39,5 40,67 - -
31 (outbreak n° 6) 24,58 22,28 38 No Ct - -
32 (outbreak n° 6) 19,39 26,8 29,89 39,48 - -
33 (outbreak n° 7) 28,79 22 26,62 33,84 - -
  1. -° : sampling unrealized.