Target gene | Primer | Nucleotide Sequence (5′-3′) | Amplicon (bp) | AT* | Reference |
---|---|---|---|---|---|
16S rRNA | 27F | AGAGTTTGATCCTGGCTCAG | 1463 | 49 | Leite et al. (2015) [53] |
 | 1492R | GGTTACCTTGTTACGACTT |  |  |  |
ureC | ureC-F | GTTATTCGTGATGGTATGGG | 317 | 52 | Stankowska et al. (2008) [36] |
 | ureC-R | ATAAAGGTGGTTACGCCAGA |  |  |  |
zapA | zapA-F | ACCGCAGGAAAACATATAGCCC | 540 | 53 | Stankowska et al. (2008) [36] |
 | zapA-R | GCGACTATCTTCCGCATAATCA |  |  |  |
rsmA | rsmA-F | TAGCGAGTGTTGACGAGTGG | 562 | 49 | Shi et al. (2016) [31] |
 | rsmA-R | AGCGAGGTGAAGAACGAGAA |  |  |  |
hpmA | hpmA-F | CCAGTGAATTAACGGCAGGT | 654 | 49 | Shi et al. (2016) [31] |
 | hpmA-R | CGTGCCCAGTAATGGCTAAT |  |  |  |
mrpA | MRP-F | ACACCTGCCCATATGGAAGATACTGGTACA | 550 | 40 | Barbour et al. (2012) [32] |
 | MRP-R | AAGTGATGAAGCTTAGTGATGGTGATGGTG |  |  |  |
 |  | ATGAGAGTAAGTCACC |  |  |  |
FliL | FliL-F | CTCTGCTCGTGGTGGTGTCG | 770 | 40 | Barbour et al. (2012) [32] |
 | FliL-R | GCGTCGTCACCTGATGTGTC |  |  |  |
ucaA | ucaA-F | GTAAAGTTGTTGCGCAAAC | 560 | 50 | Sosa et al. (2006) [35] |
 | ucaA-L | TTGAGCCACTGTGGATACA |  |  |  |
pmfA | pmfA-F | CAAATTAATCTAGAACCACTC | 618 | 54 | Zunino et al. (2003) [34] |
 | pmfA-R | ATTATAGAGGATCCCTTGAAGGTA |  |  |  |
atfA | atfA-F | CATAATTTCTAGACCTGCCCTAGCA | 382 | 50 | Zunino et al. (2000) [33] |
 | atfA-R | CTGCTTGGATCCGTAATTTTTAACG |  |  |  |