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Table 5 Genetic analysis of Thai CaKoVs compared with reference CaKoVs at putative amino acid cleavage sites

From: First detection and genetic characterization of canine Kobuvirus in domestic dogs in Thailand

Viruses Year Country Amino acid position
171/172 553/554 776/777 1054/1055 1165/1166 1330/1331 1665/1666 1759/1760 1786/1787 2176/2177
CU-53 2016 Thailand Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
CU-101 2016 Thailand Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
CU-249 2017 Thailand Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
CU-716 2018 Thailand Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
12D049 2012 Korea Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
UK003 2008 UK Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
26/BRA 2016 Brazil Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
SMCD-59 2015 China Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
CE9 2012 Australia Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
B103 2010 Africa Q/G Q/H Q/T a Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
75 2011 Africa Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
82 2010 Africa Q/G Q/H Q/T a Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
DD2 2003 Africa Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
US-PC0082 2010 USA Q/G Q/H Q/A Y/V Q/G Q/G Q/G Q/A Q/G Q/G
  1. aQ/T unique cleavage site (only found in Africa isolates)