Table 4 Gene targets and primer details
Gene target | Primer forward | Primer reverse | PCR amplicon size (bp) |
|---|---|---|---|
vlhA | 5′-ATT AGC AGC TAG TGC AGT GGC C-3’ | 5′-AGT AAC CGA TCC GCT TAA TGC-3’ | 315–372 |
obg | 5′-GTT GAT AAA GGT GGA CCA G − 3′ | 5′-TTA GTG CAG ATA TCT CAA TG-3’ | 841 |
nanA | 5’-TTGAAAAACAAAAAGTTGATGGAA-3′ | 5’-ATGATTGCATTAGCGCCTTT-3’ | 544–559 |
ugpA | 5’-TTAGATTTGCAATCGGTTTTAGA-3′ | 5’-CCGCGTCAGTTGGACTATTT-3’ | 537 |
ruvB | 5’-GAATGCCTGGAATGGGTAAA-3’ | 5’-TGTCAATGATTCCAGCGTTT-3’ | 546 |
lepA | 5’-AGCGCCGATGTTGAYAGAGT-3’ | 5’-GAGTGCTTCTTTGGCTGGAT-3’ | 462 |
uvrA | 5’-CKGCAAACATGGTTTCTTCG-3’ | 5’-TGGGTTCTTTTACATGCGGTA-3’ | 468 |