Table 1 Genotyping results of MS strains; for lepA, nanA, ruvB, ugpA and uvrA genes the allelic profile is presented. The Genebank Accession Numbers for each gene and strain are reported between brackets (Wks p.v. = weeks post vaccination)
Sample ID | Wks p.v. | Barn | vlhA | obg | lepA | nanA | ruvB | ugpA | uvrA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
IZSVE/2017/860 | MS-H | – | Type C3, group 13 (KY991388) | MS-H (KY991394) | 2 (KY991412) | 25 (KY991418) | 19 (KY991430) | 24 (KY991442) | 21 (KY991454) |
IZSVE/2013/2986–1 | 21 | 1 | Type C3, group 13 (KY991382) | parental strain ts- (KY991400) | 2 (KY991406) | 25 (KY991424) | 19 (KY991436) | 24 (KY991448) | 21 (KY991460) |
IZSVE/2013/2986–4 | 21 | 4 | Type C3, group 13 (KY991383) | reisolate ts- (KY991401) | 2 (KY991407) | 25 (KY991425) | 19 (KY991437) | 24 (KY991449) | 21 (KY991461) |
IZSVE/2013/4519–6 | 32 | 6 | Type C3, group 13 (KY991384) | parental strain ts- (KY991402) | 2 (KY991408) | 25 (KY991426) | 19 (KY991438) | 24 (KY991450) | 21 (KY991462) |
IZSVE/2013/5404–6 | 40 | 6 | Type C3, group 13 (KY991385) | MS-H (KY991403) | 2 (KY991409) | 25 (KY991427) | 19 (KY991439) | 24 (KY991451) | 21 (KY991463) |
IZSVE/2013/6965–6 | 50 | 6 | Type C3, group 13 (KY991386) | parental strain ts- (KY991404) | 2 (KY991410) | 25 (KY991428) | 19 (KY991440) | 24 (KY991452) | 21 (KY991464) |
IZSVE/2014/368–2 | 55 | 2 | Type C3, group 13 (KY991389) | MS-H (KY991395) | 2 (KY991413) | 25 (KY991419) | 19 (KY991431) | 24 (KY991443) | 21 (KY991455) |
IZSVE/2014/368–6 | 55 | 6 | Type C3, group 13 (KY991390) | reisolate ts- (KY991396) | 2 (KY991414) | 25 (KY991420) | 19 (KY991432) | 24 (KY991444) | 21 (KY991456) |
IZSVE/2014/371–1 | 55 | 1 | Type E, group 11 (KY991387) | reisolate ts- (KY991405) | 2 (KY991411) | 25 (KY991429) | 19 (KY991441) | 24 (KY991453) | 21 (KY991465) |
IZSVE/2014/373–12 | 55 | 3 | Type C3, group 13 (KY991391) | parental strain ts- (KY991397) | 2 (KY991415) | 25 (KY991421) | 19 (KY991433) | 24 (KY991445) | 21 (KY991457) |
IZSVE/2014/374–12 | 55 | 4 | Type E, group 11 (KY991393) | reisolate ts- (KY991399) | 2 (KY991417) | 25 (KY991423) | 19 (KY991435) | 24 (KY991447) | 21 (KY991459) |
IZSVE/2014/374–11 | 55 | 4 | Type C3, group 13 (KY991392) | reisolate ts- (KY991398) | 2 (KY991416) | 25 (KY991422) | 19 (KY991434) | 24 (KY991446) | 21 (KY991458) |