Table 4 Nucleotide mutations and corresponding amino acid substitutions of Staphylococcus aureus from cases of clinical mastitis
Geno type | No. | Nucleotide mutation position/corresponding amino acid substitutiona | ||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
−42 | −22 | −6 &-5 | 47 | 144 | 214 | 237 | 255 | 262 | 399 | 438 | 453 | 498 | 499 | 519 | 606 | 686 | 765 | 797 | 824 | 833 | ||
C | G | GG | G | C | G | C | G | T | C | G | T | C | T | T | T | C | T | A | C | T | ||
1 | 65 | −b | A | AA | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – |
|  |  |  | Sb | G(−2)N |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
2 | 5 | – | A | AA | – | – | – | – | – | C | T | C | G | – | – | – | C | – | C | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  |  | S | S | S | S |  |  |  | S |  | S |  |  |  |
3 | 4 | T | A | AA | – | – | – | – | – | – | T | C | G | – | – | – | C | – | C | – | – | – |
|  |  | S | S | G(− 2)N |  |  |  |  |  |  | S | S | S |  |  |  | S |  | S |  |  |  |
4 | 4 | – | A | AA | – | – | – | – | – | – | – | – | – | T | – | – | – | – | – | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |
5 | 3 | – | A | AA | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | A |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S278Y | ||
6 | 2 | – | A | AA | – | – | – | – | A | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
7 | 2 | – | A | AA | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | T |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S278F | ||
8 | 2 | – | A | AA | – | T | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | C | – | C | C | T | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S |  | S S T275I | |||
9 | 1 | – | A | AA | – | – | A | – | A | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  | Q72S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||
10 | 1 | – | A | AA | T | – | – | – | – | – | T | C | G | – | – | – | C | – | C | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N | S16I |  |  |  | S | S | S |  |  |  | S |  | S |  |  |  | ||
11 | 1 | – | A | AA | – | – | – | A | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
12 | 1 | – | A | AA | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | G | – | – | – | A |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | A229G | S278Y | ||||
13 | 1 | – | A | AA | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | A | – | – | – | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | N173 K |  |  |  |  |  | ||
14 | 1 | – | A | AA | – | – | – | – | – | – | – | – | – | – | Db | – | – | – | – | – | – | – |
|  |  |  | S | G(−2)N |  |  |  |  |  |  |  |  |  | W167Gc |  |  |  |  |  | |||