Skip to main content

Table 3 Еvolutionary distancesa between class II Newcastle disease virus genotypes and sub-genotype VIm estimated using the complete fusion gene coding sequences

From: Phylogenetic assessment reveals continuous evolution and circulation of pigeon-derived virulent avian avulaviruses 1 in Eastern Europe, Asia, and Africa

Genotype (number of analyzed sequences) I II III IV V VI VII VIII IX X XI XII XIII XIV XV XVI XVII XVIII
I (n = 139)                   
II (n = 171) 0.125                  
III (n = 10) 0.117 0.143                 
IV (n = 5) 0.104 0.130 0.084                
V (n = 90) 0.191 0.206 0.178 0.148               
VI (n = 272) 0.185 0.204 0.177 0.136 0.159              
VII (n = 476) 0.180 0.213 0.168 0.139 0.159 0.132             
VIII (n = 5) 0.144 0.165 0.133 0.100 0.129 0.119 0.122            
IX (n = 35) 0.107 0.127 0.093 0.079 0.169 0.170 0.164 0.125           
X (n = 11) 0.115 0.114 0.141 0.129 0.207 0.201 0.199 0.164 0.125          
XI (n = 14) 0.201 0.224 0.191 0.130 0.229 0.234 0.239 0.197 0.172 0.224         
XII (n = 9) 0.192 0.224 0.179 0.152 0.169 0.129 0.118 0.126 0.177 0.205 0.248        
XIII (n = 44) 0.186 0.216 0.178 0.146 0.165 0.140 0.117 0.126 0.167 0.204 0.233 0.112       
XIV (n = 56) 0.221 0.260 0.221 0.184 0.191 0.167 0.143 0.155 0.216 0.235 0.283 0.134 0.139      
XV (n = 6) 0.145 0.132 0.135 0.109 0.163 0.145 0.112 0.127 0.108 0.159 0.210 0.149 0.144 0.178     
XVI (n = 4) 0.173 0.199 0.169 0.129 0.168 0.165 0.169 0.129 0.161 0.189 0.233 0.170 0.166 0.199 0.167    
XVII (n = 56) 0.182 0.222 0.187 0.152 0.171 0.151 0.132 0.138 0.174 0.212 0.235 0.124 0.120 0.132 0.155 0.184   
XVIII (n = 18) 0.192 0.217 0.185 0.153 0.172 0.139 0.125 0.136 0.176 0.209 0.236 0.119 0.115 0.134 0.148 0.179 0.109  
VI m (n = 9) 0.193 0.218 0.185 0.158 0.176 0.112 0.143 0.134 0.182 0.222 0.242 0.148 0.155 0.182 0.155 0.184 0.173 0.157
  1. a The numbers of base substitutions per site from averaging over all sequence pairs between genotypes are shown. The analysis involved 1430 nucleotide sequences. There were a total of 1596 positions in the final dataset
\