Phylogenetic assessment reveals continuous evolution and circulation of pigeon-derived virulent avian avulaviruses 1 in Eastern Europe, Asia, and Africa

Table 3 Еvolutionary distances^a between class II Newcastle disease virus genotypes and sub-genotype VIm estimated using the complete fusion gene coding sequences

Genotype (number of analyzed sequences)	I	II	III	IV	V	VI	VII	VIII	IX	X	XI	XII	XIII	XIV	XV	XVI	XVII	XVIII
I (n = 139)
II (n = 171)	0.125
III (n = 10)	0.117	0.143
IV (n = 5)	0.104	0.130	0.084
V (n = 90)	0.191	0.206	0.178	0.148
VI (n = 272)	0.185	0.204	0.177	0.136	0.159
VII (n = 476)	0.180	0.213	0.168	0.139	0.159	0.132
VIII (n = 5)	0.144	0.165	0.133	0.100	0.129	0.119	0.122
IX (n = 35)	0.107	0.127	0.093	0.079	0.169	0.170	0.164	0.125
X (n = 11)	0.115	0.114	0.141	0.129	0.207	0.201	0.199	0.164	0.125
XI (n = 14)	0.201	0.224	0.191	0.130	0.229	0.234	0.239	0.197	0.172	0.224
XII (n = 9)	0.192	0.224	0.179	0.152	0.169	0.129	0.118	0.126	0.177	0.205	0.248
XIII (n = 44)	0.186	0.216	0.178	0.146	0.165	0.140	0.117	0.126	0.167	0.204	0.233	0.112
XIV (n = 56)	0.221	0.260	0.221	0.184	0.191	0.167	0.143	0.155	0.216	0.235	0.283	0.134	0.139
XV (n = 6)	0.145	0.132	0.135	0.109	0.163	0.145	0.112	0.127	0.108	0.159	0.210	0.149	0.144	0.178
XVI (n = 4)	0.173	0.199	0.169	0.129	0.168	0.165	0.169	0.129	0.161	0.189	0.233	0.170	0.166	0.199	0.167
XVII (n = 56)	0.182	0.222	0.187	0.152	0.171	0.151	0.132	0.138	0.174	0.212	0.235	0.124	0.120	0.132	0.155	0.184
XVIII (n = 18)	0.192	0.217	0.185	0.153	0.172	0.139	0.125	0.136	0.176	0.209	0.236	0.119	0.115	0.134	0.148	0.179	0.109
VI m (n = 9)	0.193	0.218	0.185	0.158	0.176	0.112	0.143	0.134	0.182	0.222	0.242	0.148	0.155	0.182	0.155	0.184	0.173	0.157

^a The numbers of base substitutions per site from averaging over all sequence pairs between genotypes are shown. The analysis involved 1430 nucleotide sequences. There were a total of 1596 positions in the final dataset

ISSN: 1746-6148