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Table 2 Epidemiological data of 99 S. enterica ssp. enterica strains used in study

From: PCR melting profile as a tool for outbreak studies of Salmonella enterica in chickens

Serovar MP Cluster Strain Source: farm/isolation date Epidemiological links
     Farmer Hatchery Kind of poultry/Sample Coexistence
Enteritidis   838/S/09 B Konin/16.06.2009 F1 H1 (CL) E
   1445/S/09 K46 Poddębice/25.08.2009 F1 H1 (CL) L
  MP-E1 1067/S/09 K2 Brodnica/13.07.2009 F5 H4 (CL) K
   1067/S/09 K3 Brodnica/13.07.2009 F5 H4 (CL) K
   1014/S/09 K1 Brodnica/07.07.2009 F5 H4 (CL) H
  MP-E2 1013/S/09 K4 Brodnica/07.07.2009 F5 H1 (CL) H
   1048/S/09 K8 Konin/10.07.2009 F1 H1 (CL) J
   1047/S/09 K1 Konin/10.07.2009 F1 H1 (CL) J
  MP-E3 KK10 Konin/20.02.2009 F1 H1 (CL) A
   848/S/09 Słupca/16.06.2009 F7 No data (CB) F
   865/S/09 Mińsk Mazowieck/18.06.2009 F8 H5 (BB) G
   249 Control (PIWet Puławy)    (S)  
   571/S/09 Brodnica/06.05.2009 F5 H4 (CL)  
   KK6 Konin/20.02.2009 F1 H1 (CL) A
   866/S/09 Mińsk Mazowieck/18.06.2009 F8 H5 (BB) G
  MP-E4 KK11 Konin/20.02.2009 F1 H1 (CL) A
   KK12 Konin/20.02.2009 F1 H1 (CL) A
   WK-9 Poddębice/28.03.2009 F1 H1 (CL) C
  MP-E5 1044/S/09 K2 Konin/10.07.2009 F1 H1 (CL) J
   1192/S/09 K8 Poznań/25.07.2009 F13 No data (CB)  
  MP-E6 945/S/09 Żyrardów/26.06.2009 F9 H6 (CB)  
   975/S/09 Łomża/30.06.2009 F10 No data (CB)  
   1022/S/09 K9 Turek/08.07.2009 F6 H7 (CB) I
   1143/S/09 Konin/21.07.2009 F1 H1 (CL)  
   1206/S/09 MEK Konin/29.07.2009 F1 H1 (CL)  
   1231/S/09 No data No data No data   
  MP-E7 1714/09 Konin/24.09.2009 F16 No data (CB)  
   2149/09 Siedlce/13.11.2009 F18 No data (CB)  
  MP-E8 517/S/09 Piotrków Trybunalski/27.04.2009 F4 No data (CB)  
   838/S/09 Konin/16.06.2009 F1 H1 (CL) E
   847/S/09 Słupca/16.06.2009 F7 No data (CB) F
   1085/S/09 MEK Słupca/14.07.2009 F7 H2 (CB)  
  MP-E9 KK9 Konin/20.02.2009 F1 H1 (CL) A
   WK-6 Poddębice/28.03.2009 F1 H1 (CL) C
   WK-7 Poddębice/28.03.2009 F1 H1 (CL) C
  MP-E10 KK3 Konin/20.02.2009 F1 H1 (CL) A
   1021/S/09 Turek/08.07.2009 F6 H7 (CB) I
   2619/S/10 Słupca/17.07.2010 F7 H7 (CB)  
   KK14 Konin/20.02.2009 F1 H1 (CL) A
  MP-E11 PK1 Krotoszyn/10.07.2009 F2 H2 (CB) B
   1257/S/09 K7 Słupca/03.08.2009 F7 H2 (CB)  
   1422/S/09 MEK Zduńska Wola/21.08.2009 F15 H2 (CB)  
   1061/S/09 K5 Słupca/12.07.2009 F7 No data (CB)  
   1545/S/09 MEK Słupca/08.09.2009 F7 H2 (CB) M
  MP-E12 64/S/10 Siedlce/12.01.2010 F3 No data (CB) D
   65/S/10 Siedlce/12.01.2010 F3 No data (CB) D
   1535/S/09 Poznań/05.09.2009 F13 No data (CB)  
   1573/S/09 NWJ Słupca/11.09.2009 F7 H2 (CB) N
   1748 Control (Sanepid)    (S)  
   D ATCC 13076 Control (Sanepid)    (S)  
  MP-E13 1446/S/09 K31 Poddębice/25.08.2009 F1 H1 (CL) L
   1515/S/09 Mińsk Mazowiecki/03.09.2009 F8 H5 (BB)  
   1542/S/09 NWJ Słupca/08.09.2009 F7 H2 (CB) M
   1572/S/09 NWJ Słupca/11.09.2009 F7 H2 (CB) N
   2050/S/09 K4 Kalisz/30.10.2009 F17 No data (CB)  
  MP-E14 833/S/09 Turek/15.06.2009 F6 H7 (CB)  
   1465/S/09 MEK No data No data No data   
   1171/S/09 Łosice/22.07.2009 F12 No data (BB)  
   1250/S/09 Ostrów Wlkp./03.08.2009 F14 No data (CB)  
Moscow   289 Control (PIWet Puławy)    (S)  
Virchow MP-V GAP K2 Brodnica/03.11.2009 F5 H4 (CL) O
   GAP K3 Brodnica/03.11.2009 F5 H4 (CL) O
   GAP K4 Brodnica/03.11.2009 F5 H4 (CL) O
   394 Control (PIWet Puławy)/2009    (S)  
   1188/S/09 K10 Konin/24.07.2009 F19 No data (CB)  
   1175/S/09 Żuromin/23.07.2009 F23 No data (CL)  
   PK0 Krotoszyn/10.07.2009 F2 H2 (CB) B
Colindale   180 Control (PIWet Puławy)    (S)  
Berta   324 Control (PIWet Puławy)    (S)  
Heidelberg   321 Control (PIWet Puławy)    (S)  
Hadar   1159/S/09 K2 Łomża/22.07.2009 F10 No data (CB)  
Brandenburg   584 Control (Sanepid)    (S)  
Derby   1282/09 Control (PIWet Puławy)    (S)  
Senftenberg   F23/S/09 Żuromin/19.06.2009   No data (CL)  
Typhimurium   1785/S/09 Radziejów/01.10.2009 F29 No data (CB)  
   ATCC 13311 Control (Sanepid)    (S)  
  MP-T1 1578/S/09 Kalisz/11.09.2009 F17 No data (CB)  
   1751 Control (Sanepid)    (S)  
   2205/09 Węgrów/9.11.2009 F30 No data (ES)  
  MP-T2 531 Nowy Tomyśl/29.04.2009 F24 No data (CB)  
   1563/S/09 Żyrardów/10.09.2009 F27 No data (CB)  
   1081/S/09 K1 Żuromin/14.07.2009 F23 No data (CL)  
  MP-T3 944/S/09 Poddębice/26.06.2009 F25 H3 (G)  
   960/S/09 Konin/29.06.2009 F26 H3 (G)  
   1235/S/09 Poddębice/30.07.2009 F25 H3 (G)  
   1567/S/09 Kalisz/10.09.2009 F28 No data (G)  
Infantis MP-I1 1021/S/09 Turek/08.07.2009 F6 H7 (CB)  
   1593/09 Koło/14.09.2009 F21 H7 (CB)  
  MP-I2 ZK4 Konin/01.04.2009 F19 H7 (CB) Q
   ZK5 Konin/01.04.2009 F19 H7 (CB) Q
   144/S/09 Września/10.02.2009 F20 No data (CB)  
Hadar MP-H 419/S/09 Konin/06.04.2009 F16 H8 (ES)  
   817 Control (Sanepid)    (S)  
Mbandaka   913/S/09 Ostrów Wlkp./23.06.2009 F22 H4 (CB)  
  MP-M KK1 Mława/11.03.2009 F31 H4 (CB) P
   KK2 Mława/11.03.2009 F31 H4 (CB) P
   KK3 Mława/11.03.2009 F31 H4 (CB) P
   ZK1 Konin/01.04.2009 F19 No data (CB) Q
Paratyphi   A ATCC 19150 Control (Sanepid)    (S)  
  1. Coexistence column indicates chickens having contact with each other (the same age, the same farm) marked by the same letter
  2. Kind of poultry/sample column indicates: CL commercial layer, CB commercial broiler, BB broiler breeder, G goose, S control strain, ES environmental swabs