Sample | Source of TCF | rRT-PCR Assays | cRT-PCR Assays | |||||||||||
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ERAV | ERBV | ERAV | ERBV | |||||||||||
ERAV | ERBV1 | ERBV2 | ERAV 5'-UTR | ERAV Poly | ERAV Poly 2 | ERBV 5'-UTR | ERBV Poly 1 | ERBV Poly 2 | ERBV OUTER 1c | ERBV OUTER 2c | ERBV INNER 1c | ERBV INNER 2c | ||
Serotype ERAV | ||||||||||||||
ERAV | NVSLa | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
PERV, P4 2004 A | GERCb | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
Plowright,P4 2004 A | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
T3 isolate P10/2004 A | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
T10 isolate P9/2004 A | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
945 isolate P4/2004 A | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
ERV-1 (A) Plowright P4 | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
ERV-1 (A) PERV P4 | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
Amp 87-73-69-945 | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
NS-T3 | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
NS-T10 | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
U-187 | GERC | + | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
Serotype ERBV | ||||||||||||||
ERBV | NVSL | − | + | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + |
Swiss isolate P6 2004 B | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
NS CW | GERCd | − | + | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + |
U-198V | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
NS-SD | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
Mare 189 | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
51-12NVS | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
57-10NVS | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
57-11NVS | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
57-13NVS | GERC | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
58-13 NVS | GERCd | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |